Ion Proton? Sequencer

HiSeq 2500

測(cè)序市場(chǎng)的領(lǐng)頭羊Illumina公司將推出一款新的測(cè)序儀。這個(gè)名為HiSeq 2500的系統(tǒng)將讓研究人員和臨床醫(yī)生能夠在大約24小時(shí)內(nèi)完成整個(gè)基因組的測(cè)序，即“**一個(gè)基因組”。而在這個(gè)消息發(fā)布的幾小時(shí)之前，Illumina的老對(duì)手，Life Technologis公司也宣布推出了Ion Proton測(cè)序儀，旨在**內(nèi)完**類基因組的測(cè)序，耗資約為1000美元。

過去，獲得結(jié)果的時(shí)間還不夠快和數(shù)據(jù)分析，可謂進(jìn)入臨床的兩大瓶頸。對(duì)于研究人員來說能同**分析數(shù)據(jù)是測(cè)序儀進(jìn)入臨床的關(guān)鍵因素之一。新測(cè)序儀能在24小時(shí)內(nèi)完成整個(gè)基因組的測(cè)序，正好解決了這個(gè)問題。新一代測(cè)序技術(shù)不再是大型實(shí)驗(yàn)室的專享，一些過去想都無法想象的研究方法，如今已觸手可及--兩大巨頭在小型測(cè)序儀市場(chǎng)上的競(jìng)爭(zhēng)再次打響，可謂功不可沒。那么，這次推出的兩款測(cè)序儀，同樣是**一個(gè)基因組，主要差別有哪些呢?

據(jù)Illumina公司的Flatley介紹，HiSeq 2500的價(jià)格將是74萬美元(美國(guó)報(bào)價(jià)，不適合)，也可從現(xiàn)有的HiSeq 2000升級(jí)，費(fèi)用是5萬美元。儀器采用兩種模式，既可在27小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生120 Gb，也可在標(biāo)準(zhǔn)的HiSeq運(yùn)行中產(chǎn)生600 Gb。HiSeq 2500顯然將延續(xù)和擴(kuò)大Illumina在**測(cè)序儀領(lǐng)域的**優(yōu)勢(shì)。

Life Tech的新儀器Ion Proton只需要15萬美元(2012年1月Life Tech網(wǎng)站新聞公布, 美國(guó)本土報(bào)價(jià)，不適合。有網(wǎng)友補(bǔ)充，15萬美金是主機(jī)不帶附屬設(shè)備的，全部買齊大概要40萬美金。)。雖然目前Life Tech還沒有提供詳細(xì)的數(shù)據(jù)，看來Ion Proton在主攻的個(gè)人型測(cè)序儀市場(chǎng)上將再度掀起熱潮，因?yàn)樵诿绹?guó)NIH可能削減經(jīng)費(fèi)的形勢(shì)下，Ion Proton的價(jià)格可能會(huì)吸引相當(dāng)一部分科學(xué)家。目前Ion PGM的通量從314芯片的幾十Mb到316芯片的幾百M(fèi)b，以及新上市的Ion 318芯片超過1GB。

Broad研究院基因組測(cè)序和分析項(xiàng)目的聯(lián)合主管，同時(shí)也是Ion Proton系統(tǒng)的早期用戶的Chad Nusbaum認(rèn)為：Ion Proton系統(tǒng)的價(jià)格將是主要賣點(diǎn)。他覺得或許(兩者)數(shù)據(jù)質(zhì)量會(huì)有點(diǎn)差別，但不會(huì)太多。Ion Proton系統(tǒng)的低價(jià)格會(huì)吸引不少粉絲。對(duì)于Illumina的新儀器，他認(rèn)為，速度快當(dāng)然很好，但成本也是個(gè)考慮因素。(以上信息來自福布斯)不過毫無疑問，在**測(cè)序儀市場(chǎng)已經(jīng)占盡先機(jī)的Illumina并不會(huì)輕易放棄平價(jià)測(cè)序儀市場(chǎng)，我們期待不久的將來，Illumina還會(huì)再宣布Miseq的升級(jí)。早買儀器能早出結(jié)果早發(fā)文章，晚點(diǎn)買呢，或許能買到更先進(jìn)的版本，但又怕等決定買時(shí)人家已經(jīng)發(fā)表文章了，公布距離真正發(fā)售還有點(diǎn)時(shí)間，大家還Hold不Hold得住呢?

自此，兩大測(cè)序巨頭的測(cè)序競(jìng)賽再次升級(jí)。此前三家測(cè)序巨頭的競(jìng)爭(zhēng)，使得測(cè)序儀讀取DNA數(shù)據(jù)的速度越來越快，速度提升之快已經(jīng)超越了有名的“摩爾法則”對(duì)微處理器加速的預(yù)測(cè)。**回合中，Illumina推出的Genome Analyzer，迅速占領(lǐng)了新一代測(cè)序的市場(chǎng)，先撥頭籌。相比之下ABI推出的SOLiD雖然性能強(qiáng)大，可惜在單機(jī)高達(dá)50萬美元起步的**測(cè)序儀市場(chǎng)，還是稍晚了一步。ABI的轉(zhuǎn)機(jī)出現(xiàn)在2010年，不過當(dāng)時(shí)已不再是ABI，而是合并之后的Life Technologies。這年初，Ion Torrent公司一鳴驚人，推出了一款廉價(jià)小巧的半導(dǎo)體測(cè)序儀。Ion Torrent的創(chuàng)始人是Jonathan M. Rothberg，這個(gè)測(cè)序領(lǐng)域的傳奇人物在2000-2007年間創(chuàng)立的454 公司推出了**臺(tái)新一代測(cè)序儀，被羅氏收購(gòu)。2007年-2010年他成立Ion Torrent公司，幾個(gè)月后，這家公司被Life Tech收購(gòu)，Rothberg 成為L(zhǎng)ife Tech公司半導(dǎo)體測(cè)序部門的領(lǐng)頭人。Ion PGM雖不是**個(gè)上市的個(gè)人型測(cè)序儀，但因價(jià)格低廉、表現(xiàn)出色，獲得了很好的市場(chǎng)反應(yīng)，相比50萬美元以上級(jí)別的超豪華設(shè)備，5-10萬美元級(jí)別的Ion PGM更容易為普通實(shí)驗(yàn)室接受，無怪迅速成為當(dāng)年賣的快的測(cè)序儀。Illumina隨即推出價(jià)格在10萬美元級(jí)別的個(gè)人型測(cè)序儀MiSeq。

短短五年的時(shí)間，個(gè)人基因組測(cè)序費(fèi)用已降低了1000倍。測(cè)序技術(shù)發(fā)展之快，令人驚嘆。

**一個(gè)基因組，聽上去很美，但也對(duì)數(shù)據(jù)分析提出了更高的挑戰(zhàn)。**一個(gè)，分析得過來么?費(fèi)用如何?之前有專家預(yù)測(cè)，盡管千元基因組目標(biāo)的實(shí)現(xiàn)指日可待，但對(duì)于測(cè)序后的數(shù)據(jù)分析，則可能還要再加兩個(gè)零。測(cè)序儀的不斷升級(jí)也意味著，另一個(gè)數(shù)據(jù)分析市場(chǎng)的大門敞開了。學(xué)生物的將來不學(xué)生物信息學(xué)恐怕不行了!有網(wǎng)友打趣，也許再過十年去面試的時(shí)候，電子簡(jiǎn)歷后面還要附上自己的全基因組序列。