上個月,Life Technologies和Illumina各自發(fā)布了一款新產品,旨在**內完**類基因組測序。引起了行業(yè)內的軒然**。然而,在上周召開的基因組生物學技術進展年會(AGBT)上,英國Oxford Nanopore Technologies公司(簡稱Oxford)宣布推出一款便攜式的基因組測序儀,約摸只有U盤大小,立即引起市場轟動。
相信大家還對Oxford公司的納米孔測序平臺GridION念念不忘:該系統(tǒng)將使用帶有多個蛋白納米孔的陣列芯片來分析DNA、RNA和蛋白等。該陣列芯片放置在一次性的cartridge內,cartridge隨后上樣到節(jié)點(node)內。用戶可根據需要,連接若干個這樣的節(jié)點,組成一個可擴展的測序平臺。
就在大家對這款儀器翹首盼望時,Oxford又宣布了一個爆炸性的消息,便攜式的測序系統(tǒng)MinION即將在下半年上市。這款儀器只有U盤大小,價格低于900美元。這兩款系統(tǒng)都有望帶來高達100 kb的讀長,而原始錯誤率大約在1%左右。
據Oxford介紹,GridION有望帶來15分鐘的人類基因組測序,而MinION則更是一個大轉折(game-changer)。Oxford的CEO Gordon Sanghera指出,即插即用的MinION將帶來DNA測序的更廣泛應用,“這將允許非專業(yè)科學家提取DNA信息。您需要的只是一臺筆記本電腦和軟件。”不過,MinION設備是一次性的,產量也不如GridION那么高。
除了大小,讓人驚異的還有讀長。目前新一代測序技術的讀長普遍在200-300 bp,羅氏454的平臺去年升級為1000 bp,第三代PacBio RS系統(tǒng)的讀長達到3000 bp,當時已視為重大飛躍。如今,Oxford的測序平臺將帶來100 kb的讀長,有望解決很多目前無能為力的問題。
強大競爭對手的出現,讓本來就不平靜的測序市場再次掀起波瀾。各大測序公司的股價應聲齊跌。Life Technologies跌6%,Illumina跌3%,PacBio跌5%,Complete Genomics跌3%。
然而,以上皆為Oxford公布的數據,目前尚未發(fā)表文章,也還沒有客戶試用過。因此,可能要等到早期試用客戶使用過,或有論文發(fā)布,才能真正確定該平臺的性能是否如此出色。
參考文章:
Oxford Nanopore To Sell Tiny DNA Sequencer
滬公網安備 31011002002624號